Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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PtprtQ99M80 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
PtprtQ99M80 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
PtprtQ99M80 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
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