Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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