Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Gga3Q8BMI3 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms