Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Sh3bp1P55194 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms