Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RxraP28700 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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