Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
P10404 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms