Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Opn1mwO35599 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms