Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
H2-Q1O19441 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms