Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms