Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp54Q8BL06 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms