Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms