Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms