Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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