Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
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Rpusd2Q149F1 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rpusd2Q149F1 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
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