Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr75-ps1-201ENSMUST00000135477 938 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms