Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Sh3bp1P55194 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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