Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P10404 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
P10404 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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