Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Speer3W4VSP1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer3W4VSP1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms