Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Krt27Q9Z320 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt27Q9Z320 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms