Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Homer1Q9Z2Y3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Homer1Q9Z2Y3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms