Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Crlf3Q9Z2L7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms