Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms