Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn6Q9Z262 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn6Q9Z262 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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