Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms