Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dctn3Q9Z0Y1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dctn3Q9Z0Y1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms