Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup160Q9Z0W3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nup160Q9Z0W3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nup160Q9Z0W3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms