Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms