Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PapolbQ9WVP6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PapolbQ9WVP6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PapolbQ9WVP6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms