Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slit3Q9WVB4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit3Q9WVB4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit3Q9WVB4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms