Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme3Q9WV85 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme3Q9WV85 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms