Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Opn3Q9WUK7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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