Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nrf1Q9WU00 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrf1Q9WU00 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms