Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp18Q9WTV6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp18Q9WTV6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms