Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim3Q9R1R2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim3Q9R1R2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms