Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slit2Q9R1B9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slit2Q9R1B9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms