Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrpxQ9R0M3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms