Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod1Q9R0E2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod1Q9R0E2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms