Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Wdr54Q9R0D8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms