Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh2d3cQ9QZS8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms