Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms