Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx4Q9QY61 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms