Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp3Q9QY23 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp3Q9QY23 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms