Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nufip1Q9QXX8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nufip1Q9QXX8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms