Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb1Q9QXJ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb1Q9QXJ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms