Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Homer2Q9QWW1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Homer2Q9QWW1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms