Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rai2Q9QVY8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rai2Q9QVY8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms