Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psma6Q9QUM9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma6Q9QUM9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms