Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln8Q9QUK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cln8Q9QUK3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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