Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm2bQ9JME9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms