Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep6Q9JM62 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms